Muzeum Warszawy ma dziesięć oddziałów.
1. Główna siedziba znajduje się na Rynku Starego Miasta 28-42 w 11 staromiejskich kamieniczkach.
Dawne komnaty mieszczan po odbudowie ze zniszczeń II wojny światowej i niedawnej rekonstrukcji zamienione zostały w nowoczesne przestrzenie wystaw. W 21 gabinetach znajdują się dzieła sztuki i rzeczy codziennego użytku. Wiele z nich to dary warszawianek i warszawiaków oddane do Muzeum jako najcenniejsze rzeczy, które przetrwały po poprzednich pokoleniach. Są tu także obrazy Wojciecha Fangora, zegary warszawskiego zegarmistrza Pateka czy rzeźba delfina uratowana z potopu szwedzkiego i setki przedmiotów z wizerunkiem warszawskiej Syreny. W holu jednej z kamieniczek Muzeum znajduje się oryginalny pomnik warszawskiej Syrenki - tej, której kopia stoi na środku rynku staromiejskiego. A ze szczytu jednej z najwyższych kamieniczek zachwyca widok na Stare i Nowe Miasto.
2. Galeria Rynek 30 znajduje się w jednej z tych kamieniczek.
Można tam obejrzeć wystawy tworzone przez młode artystki i artystów. Są one tworzone przy pomocy różnorodnych środków wyrazu. Jest to przestrzeń współpracy z organizacjami pozarządowymi, instytucjami naukowymi czy edukacyjnymi.
Oto urywek ekspozycji pt: "Jak powraca las".
3. Muzeum Farmacji umieszczono na sąsiedniej ulicy Piwnej 31/33
4. Muzeum Odbudowy Starówki - Centrum Interpretacji Zabytku - ulica Brzozowa 11/13
W tym oddziale Muzeum Warszawy poznaje się Stare Miasto, jego przedwojenny kształt, a także historię zniszczenia i odbudowy. Tu dowiadujemy się dlaczego wpisano Starówkę na listę światowego dziedzictwa Unesco. Na wystawie znajdują się oryginalne materiały na temat polskich architektów, konserwatorów, historyków i historyków sztuki, którzy podjęli się dzieła rekonstrukcji niemal całkowicie zrujnowanego historycznego centrum miasta.
Na zdjęciu kilka gablot ze zdjęciami.
5. Barbakan ul. Nowomiejska 15/17
